Osrednji del našega dela sloni na znanju, izkušnjah in odločanju zunanjih znanstvenih strokovnjakov agencije EFSA. Za večino ocen organa so odgovorni znanstveni sveti agencije EFSA. Vsak od desetih svetov pokriva drugo področje prehranske in krmne verige.
Naloga znanstvenega odbora je podpirati delo svetov na področju horizontalnih znanstvenih vprašanj. Osredotoča se na razvoj usklajenih metodologij za ocenjevanje tveganj na področjih, kjer pristopi na ravni EU še niso opredeljeni.
Članstvo v znanstvenem odboru in desetih svetih se po temeljitem in preglednem izbirnem postopku obnavlja vsakih pet let.